資訊產業是我國與國際接軌的重要產業之一，美國林肯總統曾說過：「專利制度好比在天才之火上澆下利益的燃料」，而產業的蓬勃需要維繫在健全制度之下，對於資訊產業亦然。軟體專利的爭議始終不斷，似乎現今我們正處在軟體專利叢林密佈、專利流氓橫行的時代，許多人士表示軟體專利實在是一荒謬之制度，更有團體致力於終結軟體專利。本研究將針對「軟體專利標的適格性」加以研究，探討什麼樣的電腦軟體相關請求項 （claim）宜或不宜屬於專利法所保護的範疇。本研究將統計我國過往之專利申請之訴願案件及行政訴訟，再對照歐美之實務發展，以評估我國2008年版電腦軟體相關發明審查基準在專利標的適格性方面之規定。

Information technology is one of the significant industries of Taiwan. Abraham Lincoln stated that ”the patent system added the fuel of interest to the fire of genius.” Therefore, a good patent system can promote the development of industries, including the IT industry. It seems that we are living in one age with so many disputes about software patent, in which there are patent thickets and patent trolls everywhere. Many people argue that software patent is an absurdity, and many groups try to end software patent. This article focuses on “software patent subject matter eligibility” to discuss which kinds of software related claim should be classified into patentable subject matter. This article also gathers cases of petition and administrative litigation related to software patent prosecution in our country, and compares them with those of Europe and America to analyze the Software Patent Examination Guidelines in 2008 of Taiwan.

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期刊
王立達(2010)，託古改制或重新出發：從Bilski 案看美國方法專利標的適格之最新發展，電子商務與智慧財產權的新思惟與展望學術研討會。
洪志勳(2006)，探究「歐洲軟體專利指令草案」引發的軟體專利爭議，科技法律透析，第18卷1期。
洪志勳(2007)，美國軟體專利之問題分析，科技法律透析，第20卷2期。
洪志勳(2007)，美國軟體專利發展回顧及現況分析，科技法律透析，第19卷7期。
胡心蘭、蔡岳勳(2009)，促進抑或是阻礙創新? 從法律經濟學角度審視美國商業方法專利之適格性爭議 — 以In re Bilski 案為例，政大智慧財產評論，第7卷第2期。
袁建中(2009)，美國軟體專利發展十年回顧，智慧財產季刊，第69期。
袁建中(2009)，歐洲軟體專利發展十年回顧，智慧財產季刊，第70期。
劉國讚(2010)，電腦軟體相關發明申請專利範圍之解釋與侵權－以日本實務為中心，智慧財產權月刊，第136期。
顏上詠、陳帝利(2004)，歐洲與美國商業方法專利學理之研究 ，東海大學法學研究，第二十一期。

專書
王義智 (2006)，自由軟體產業發展與商機研究，資策會。
李茂堂(1997)，專利法實務，健行文化。
陳文吟(2010)，我國專利制度之研究，五南圖書。
陳哲宏，陳逸南，謝銘洋，徐宏昇(1993)，專利法解讀，月旦出版社。
陳家駿，呂榮海 (1987)，從科技與法律的探討--電腦軟體著作權，蔚理法律出版社。
陳銘祥，吳尚昆，陳昭華，張凱娜(2009)，智慧財產權與法律，元照出版社。
曾陳明汝(2004) ，兩岸暨歐美專利法，學林文化。
楊崇森(2007)，專利法理論及實務，三民書局。
資策會 (2008)，2008資訊工業年鑑，ITIS計畫。

廖和信 (2003)，專利就是科技競爭力，天下文化。
劉孔中、Heinz Goddar、Christian Appelt (2010)，歐洲專利手冊，翰蘆圖書出版有限公司。
劉孔中、宿希成 (2002)，電腦程式相關發明專利保護之研究─法律與技術之分析，翰蘆圖書出版有限公司 。
蔡明誠(1997)，發明專利法研究，台灣大學法學叢書。
謝銘洋 (2004)，智慧財產權之基礎理論，翰蘆圖書。
謝銘洋(2008)，智慧財產權法，元照出版社。

學位論文
李界昇(2003)，開放原始碼模式下的法律糾紛與風險 -- 從 SCO v. IBM 案出發，交通大學科技法律研究所碩士論文。
藍弘仁(1997)，電腦軟體相關發明是否屬「法定可予專利事項」問題之研究—中美專利審查基準，東吳大學法律研究所論文。
林金東(2008)，軟體可專利性相關問題之研究，政治大學法學院碩士論文。
洪志勳(2007)，軟體專利爭訟案例之分析與制度發展之研究，交通大學科技法律研究所碩士論文。
報導
李娟萍，軟體發明審查變更 垃圾專利大增，經濟日報，2006年8月16日。
李娟萍，師法日本恐成沒牙老虎，經濟日報，2006年8月16日。
網路資料
Patent Absurdity中文字幕，
http://people.debian.org.tw/~chihchun/wp-content/uploads/2010/05/Patent_Absurdity.cht.srt 。

立法院，專利法修法理由，http://lis.ly.gov.tw/lgcgi/lglaw?@21:1804289383:f:NO%3DE01924*%20OR%20NO%3DB01924$$11$$$PD%2BNO 。

自由軟體與開放原始碼，
http://www.csie.nctu.edu.tw/~tsaiwn/course/introcs/history/linux/linux.tnc.edu.tw/techdoc/cledoc/node9.html 。

智慧財產局，「日本專利審查實務與電腦相關發明審查基準」，政府出版資訊網， http://open.nat.gov.tw/OpenFront/report_download.jspx?sysId=C08904795&fileNo=001 。

智慧財產局，96年專利行政訴訟裁判選輯
http://www.tipo.gov.tw/ch/AllInOne_Show.aspx?path=3014&guid=58c6a758-217f-4cb5-8bfe-ea4a07f7abae&lang=zh-tw 。

智慧財產局，98年年報，
http://www.tipo.gov.tw/ch/AllInOne_Show.aspx?path=3655&guid=c04aba7d-f925-428a-bc8f-5f18a51df963&lang=zh-tw

智慧財產局，五大專利局專利申請美中雙雙突破歷史件數
http://www.tipo.gov.tw/ch/News_NewsContent.aspx?NewsID=5029 。

智慧財產局，專利審查基準研訂之始末---代序言，http://www.tipo.gov.tw/ch/AllInOne_Show.aspx?path=626&guid=ef0205c9-d7a5-4dbc-ac27-3e6c19dcbbd6&lang=zh-tw 。

葉名軒摘錄，袁建中主講，全球軟體專利發展趨勢與自由軟體http://www.openfoundry.org/news/1524 。

劉江彬，智慧財產法律保護之競合問題
http://tim.nccu.edu.tw/paulliu/book/book1_6.htm 。

外文
期刊
Carl Shapiro(2001), Navigating the Patent Thicket: Cross Licenses, Patent Pools, and Standard-Setting2001, Innovation Policy and the Economy (Vol. I) (Jaffe, Adam B. et al., eds), MIT Press.
David S. Evans and Anne Layne-Farrar(2004), Software Patents and Open Source: The Battle Over Intellectual Property Rights, Virginia Journal of Law and Technology, Forthcoming
James Bessen and Robert M. Hunt(2004), “An Empirical Look at Software Patents”, FRB of Philadelphia Working Paper.
John R. Allison and Tiller, Emerson H. (2003), “The Business Method Patent. Myth”, 18 BERKERLEY TECH. L.J. 987.
專書
Alan L. Durham(2009), Patent Law Essentials: A Concise Guide, 3rd Ed.
Gregory A. Stobbs(2000), “Software Patents”. second edition, Aspen Publishers.
Roger Schechter(2004), John Thomas, Principles of Patent Law, 2nd Ed
網路資料
A copyright protects an original artistic or literary work; a patent protects an invention,
http://www.uspto.gov/trademarks/basics/trade_defin.jsp .

Alex Gardiner, “Business Methods and Computer Implemented Inventions (CII): Their patentability under the EPC＂, EPO, Nov.14, 2007, http://www.dziv.hr/webcontent/file_library/izvori_inf/novosti/CARDS_2003/softver/sw4.pdf .

Are software patents in New Zealand a thing of the past?
http://www.nzlawyermagazine.co.nz/Archives/Issue141/141F6/tabid/2472/Default.aspx .

Brief report on the ECSS 2010,
http://www.informatics-europe.org/ECSS/ECSS10/report.php .

Business Methods,
http://www.redetec.org.br/publique/media/xirepict_mini_jeff_parte4_21_10_2008.pdf.

CHART OF THE DAY: Microsoft Spends Eight Times As Much On R&D As Apple,
http://www.businessinsider.com/chart-of-the-day-rd-for-tech-companies-2010-5 .

Computer Software Copyright Act of 1980,
http://itlaw.wikia.com/wiki/Computer_Software_Copyright_Act_of_1980 .

Computer-implemented inventions at the European Patent Office,
http://www.informatics-europe.org/ECSS/ECSS10/Slides/Kruspig.pdf .

End Software Patents
http://endsoftpatents.org/ .

Final Report of the National Commission on New Technology Uses of Copyrighted Works,
http://digital-law-online.info/CONTU/contu1.html .

Free and open source software,
http://en.wikipedia.org/wiki/Free_and_open_source_software .

Hideo, Patentability of Business Method Inventions and Inventions with Non-technical Features in Japan versus the US and Europe http://www.furutani.co.jp/office/ronbun/Business_method_patents_in_Japan.pdf .

Inventors of the Modern Computer,
http://inventors.about.com/library/weekly/aa050298.htm .

Knuth–Morris–Pratt algorithm,
http://en.wikipedia.org/wiki/Knuth%E2%80%93Morris%E2%80%93Pratt_algorithm .

New Zealand Legislation: Patent Bills,
http://legislation.govt.nz/bill/government/2008/0235/latest/whole.html .

Patent Absurdity: how software patents broke the system,
http://patentabsurdity.com/ .

Patentability of Business Method Inventions andInventions with Non-technical Features in Japan versus the US and Europe
http://www.furutani.co.jp/office/ronbun/Business_method_patents_in_Japan.pdf .

Patentability of computer-implemented inventions,
http://ec.europa.eu/internal_market/indprop/comp/index_en.htm .

Richard Stallman, Why Open Source misses the point of Free Software,
http://www.gnu.org/philosophy/open-source-misses-the-point.html .

Software-Based Inventions
http://digital-law-online.info/lpdi1.0/treatise61.html .

Stuart J.H. Graham & David C. Mowery “Intellectual Property Protection in the U.S Software Industry”, http://www.ic.gc.ca/eic/site/ippd-dppi.nsf/vwapj/-07-AN%20Graham-Mowery.pdf/$file/-07-AN%20Graham-Mowery.pdf .

Why All Business Methods Achieve A Technical Effect,
http://www.bustpatents.com/aharonian/bzmtdtch.htm .

コンピュータ・プログラムに関する発明についての審査基準
http://www.furutani.co.jp/office/ronbun/soft-standard-1.pdf .