cDNA 微陣列是近十年才發展出來的生物科技，然而在cDNA 微陣列實驗過程中，常會遇到一些問題。例如：在量測螢光強度時，光電倍增管參數的選取，是否會影響到後續的數據分析之結果。在量測螢光強度時，所用雷射光束的大小會影響到影像的解析度，要如何應用統計的方法去估計雷射光束的大小。還有實驗結果所得到的數據，呈現出系統性的異常現象等等問題。本論文主要是應用一些統計的方法，解決了在 cDNA微陣列實驗中遇到的這幾個問題。

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