簡易檢索 / 詳目顯示

研究生: 江鈺詔
Jiang, Yu-Jhao
論文名稱: T 細胞動態校正的馬可夫鏈模型及多重基因調控系統的需求法則
指導教授: 許文郁
Shu, Wun-Yi
口試委員:
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 理學院 - 統計學研究所
Institute of Statistics
論文出版年: 2010
畢業學年度: 98
語文別: 中文
論文頁數: 49
中文關鍵詞: T-細胞免疫系統動態校正馬可夫鏈
外文關鍵詞: T-cell, immune system, kinetic proofreading, Markov chain
相關次數: 點閱:2下載:0
分享至:
查詢本校圖書館目錄 查詢臺灣博碩士論文知識加值系統 勘誤回報
  • 近年來,隨著生物學的研究,由較基礎的基因或蛋白質的分析,演變成較大整體組織的探討,為了進一步了解整個系統生物學的奧妙,我們用簡單的數學模
    型去描述重要的生物網絡,並且驗證這些模型可以預測生物體的運作。
    在此我們研究兩個議題,其一是在免疫系統中,細胞如何正確地分辨外來的訊號,以便有效殺死病毒,透過動態校正(Kinetic proofreading) 的模型我們知道細胞分辨的錯誤率小於10-6的機制,此篇用馬可夫鏈(Markov Chain)的模型取代動態校正,我們將得到一個更靈活且機動性的模型。其二是推廣大腸桿菌的乳糖調控系統,在極小化誤差負擔率(minimal error load)下,系統會如何選擇調控的機制,我們將之推廣至三個輸入狀態(input state),只要知道輸入狀態是受到催化劑(activator)或者受到抑壓劑(repressor)的調控,即可馬上得到乳糖調控系統會選擇哪一個機制。


    第一章 緒論 1 1.1 研究背景 1 1.2 研究動機與目的 1 第二章 免疫系統與平衡辨識 3 2.1 免疫系統與T細胞 3 2.2 平衡辨識 5 2.3 平衡辨識無法解釋T細胞的低錯誤率 6 第三章 動態校正模型 8 3.1 動態校正 8 3.2 動態校正模型 9 3.3 動態校正發生在不同的辨識過程 10 第四章 T細胞動態校正的馬可夫鏈模型 12 4.1 統計分析工具 12 4.2 T細胞辨識在馬可夫鏈下的錯誤率 15 4.3 啟動T細胞訊號所需步驟的期望值與變異數 19 4.4 模型比較與結論 26 第五章 Savagreau需求法則 27 5.1 基因調控模式 27 5.2 突變與誤差負擔 29 第六章 多重基因調控系統的需求法則 33 6.1 乳糖系統調控機制 33 6.2 多重調控機制 38 6.3 結論 45

    Alon, U. (2007). An introduction to systems biology : design principles
    of biological circuits. p.175-188,p.215-230 Chapman & Hall,
    Goldstein, B., Faeder, J.R., and Hlavacek, W.S.(2004). Mathematical and
    computational models of immune-recepter signaling. Nat. Rev.Immunol.
    Hopfield, J.J.(1974). Kinetic proofreading: a new mechanism for reducing
    errors in biosynthetic processes requiring high specificity. Proc.
    Natl. Acad. Sci. U.S.A.71:4135-4139.
    McKeithan, T.W.(1995). Kinetic proofreading in T-cell receptor signal
    transduction. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92:5042-5046.
    Ross S.M. (2007). Introduction to Probability Models, 9thed p.185-191,
    p.284-292
    Savageau, M.A.(1977). Design of molecular control mechanisms and the
    demand for gene expression. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 74:5647-51.
    Savageau, M.A.(1989). Are there rules governing patterns of gene
    regulation? In theoretical biology, Groodwin, B.C. and Saundrs, P.T.,
    Eds. Edinburgh University Press. p.42-46.
    Shinar, G., Dekel, E., Tlusty, T., and Alon, U.(2006). Rules for gene
    regulation based on error minimization. Proc. Natl. Acad. Sci, U.S.A.
    103:3999-4004.

    無法下載圖示 全文公開日期 本全文未授權公開 (校內網路)
    全文公開日期 本全文未授權公開 (校外網路)
    全文公開日期 本全文未授權公開 (國家圖書館:臺灣博碩士論文系統)
    QR CODE