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研究生: 廖家宏
論文名稱: Polya 計數定理在系統生物學研究的一個應用
指導教授: 許文郁
口試委員:
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 理學院 - 統計學研究所
Institute of Statistics
論文出版年: 2010
畢業學年度: 98
語文別: 中文
論文頁數: 72
中文關鍵詞: 系統生物學網路模體
外文關鍵詞: Polya, motif, FFL, SIM, DOR
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  • 近年來,生物體的研究發展,已經從最基本的基因定序解碼,進一步的走向了解DNA、RNA和蛋白質之間的相互作用影響,也就是大家常聽到的系統生物學。系統生物學就是將DNA、RNA和蛋白質三者彼此之間的交互作用等資訊加以整合,並運用這些資料去建立數學計量模型,以期能掌握所有生物基因與組織間的關係及運作。生物網路相當複雜,彼此之間的可能組合個數也很多種,我們利用組合數學中的波利亞(Polya)計數定理,可以準確計算出多節點網路的所有可能組合個數,並研究那些生物網路中常見的模體其背後所隱藏的優勢,為何能在經過數十億年的不斷進化突變過程中,還依然能夠大量的存在生物網路中。


    第一章 緒論 1 1.1 研究背景 1 1.2 研究動機與目的 1 1.3 論文結構 2 第二章 轉錄網路 3 2.1 輸入函數 5 2.2 動力學和反應時間 7 2.3 隨機網路和網路模體 9 第三章 自我調控 12 第四章 前饋迴路 16 第五章 單輸入模組和密集重疊調控 27 第六章 Polya計數定理和多節點圖形的計數 32 6.1 Polya計數定理 32 6.2 計算多節點的網路圖型數 37 6.2.1 三個節點 38 6.2.2 四個節點 42 6.2.3 五個節點 49 6.2.4 六個節點 58 第七章 結論 68 參考文獻 69 附錄 72

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