近年來，生物晶片中的基因晶片已經成為生命科學裡重要研究工具，其中又以Affymetrix公司所生產的基因晶片最為常用。由於晶片的製作成本費用高，所以做晶片數據分析時，受限於樣本數太少，資料數不足的困境，藉由Affymetrix晶片資料庫的建立，使得我們有大量的數據，以往的Affymetrix晶片分析，是找出晶片上的顯著基因，但我們有別於顯著基因的發現，目的是找出晶片上特殊表現的基因。
透過統合分析，希望從中找出基因表現的特殊資訊，由於一片晶片上有22283個探針組(基因片段)，大部分的探針組亮度分佈呈現單峰，而少部分的探針組亮度分佈為雙峰，對這些雙峰的探針組表現感到興趣，且因為這些基因片段表現量會隨器官的種類不同而異，透過這些少數的雙峰表現基因片段，發展出一套生物顯著指標（BSI），而不需使用整片晶片上的所有探針組的資訊，亦可省去將探針組進一步整合為基因表現的步驟，，即可將器官以及其器官內次種類正確的分類。

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