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研究生: 江霖
論文名稱: 物種稀釋曲線之統計推論
Statistical Inference for Species Rarefaction Curve
指導教授: 趙蓮菊
口試委員: 沈宗荏
黃文瀚
學位類別: 碩士
Master
系所名稱: 理學院 - 統計學研究所
Institute of Statistics
論文出版年: 2011
畢業學年度: 99
語文別: 中文
論文頁數: 70
中文關鍵詞: 物種稀釋曲線生物多樣性樣本涵蓋
外文關鍵詞: rarefaction curve
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  • 在生物多樣性的研究領域中,學者常利用總物種數目來比較兩群落間的物種豐富度,但物種數會受到收集到的樣本數影響,故會利用物種稀釋函數將收集到的樣本稀釋到相同的樣本數,以此來比較兩群落的物種豐富度,而物種稀釋曲線在本文第二章的文獻回顧中都會有詳盡的定義以及估計方法。
    本文主要的研究主題分成三個部分,第一部分為由Alroy (2010),Jost (2010)以及Chao和Jost (2011)提出以物種稀釋函數對樣本涵蓋率作圖的想法,將物種稀釋函數稀釋到相同樣本涵蓋率下,利用此比較群落間的物種豐富度大小,本文對此方法以例題加以詳細闡述;第二部分則是藉由Chao (2000)所提出的兩群落共同種樣本涵蓋率的概念,而建構出雙群落共同種稀釋曲線及其估計量,並且利用電腦模擬的方式,觀察估計量的表現;最後則是修正了稀釋函數使用傳統拔靴法在計算估計量之標準差時因樣本偏差而造成低估的問題。


    第一章 緒論 1 第二章 模型與符號介紹與文獻回顧 4 2.1 模型與符號介紹 4 2.1.1 符號定義 4 2.1.2 抽樣方法及模型假設 6 2.2 稀釋曲線相關文獻回顧 6 2.3 樣本涵蓋率相關文獻回顧 7 第三章 單一群落稀釋曲線相關主題 10 3.1 研究動機 10 3.2 物種稀釋函數、樣本涵蓋率稀釋函數的估計量 10 3.2.1 物種稀釋函數及其估計式 11 3.2.2 樣本涵蓋率稀釋函數及其估計式 11 3.2.3 物種數稀釋函數的標準差 16 3.3 模擬研究與討論 20 3.4 實例分析 22 第四章 兩群落稀釋曲線相關主題 28 4.1 研究動機 28 4.2 共同種稀釋函數、樣本涵蓋率函數的估計量 28 4.2.1 共同種稀釋函數及其估計式 29 4.2.2 共同種樣本涵蓋率稀釋函數及其估計式 29 4.2.3 共同種稀釋函數估計量的標準差 31 4.3 模擬研究與討論 35 4.4 實例分析 37 第五章 結論及後續研究 40 附錄 42 附表一 42 附表二 50 參考文獻 69

    [1] Alroy, J. (2010). “The shifting balance of diversity among major marine animal groups”. Science 329, 1191-1194.
    [2] Chao, A. (1984). “Nonparametric estimation of the number of classes in a population”. Scandinavian Journal of Statistics, 11, 265-270.
    [3] Chao, A., Hwang, W.-H., Chen, Y.-C. and Kuo, C.-Y. (2000). “Estimating the number of shared species in two communities”. Statistica Sinica 10, 227-246.
    [4] Chao, A. and Jost, L. (2011) “Rarefaction based on sample coverage”. Manuscript.
    [5] Chao, A., Lee, S-M and Chen, T-C. (1988). “A generalized Good's nonparametric coverage estimator”. Chinese Journal of Mathematics 16, 189-199.
    [6] Chao, A. Ma, M.-C. and Yang, M. C. K. (1993) . “Stopping rule and estimation for recapture debugging with unequal detection rates”. Biometrika 80, 193-201.
    [7] Chao, A. and Shen, T.-J. (2004). “Non-parametric prediction in species sampling”. Journal of Agricultural, Biological and Environmental Statistics 9, 253-269.
    [8] Chao, A., Shen, T.-J. and Hwang, W.-H.(2006). “Application of Laplace's boundary-mode approximations to estimate species and shared species richness”. Australian and New Zealand Journal of Statistics 48, 117-128.
    [9] Colwell, R. K., Mao, C. X., and J. Chang. (2004). “ Interpolating, extrapolating, and comparing incidence-based species accumulation curves”. Ecology 85(10):2717–2727
    [10] Esty, W. (1985). “Estimation of the number of classes in a population and the coverage of a sample”. Mathematical Scientist 10, 41-50.
    [11] Good, I. J. (1953). “The population frequencies of species and the estimation of population parameters”. Biometrika 40, 237-264.
    [12] Gotelli, N. and Colwell. R. K. (2001). “Quantifying biodiversity: procedures and pitfalls in the measurement and comparison of species richness”. Ecology Letters 4, 379-391.
    [13] Haas, P. J. and Stokes, S. L. (1998). “Estimating the number of classes in a finite population”. Journal of the American Statistical Association 93, 1475-1487.
    [14] Heck, K. L., Jr., G. van Belle, and D. Simberloff. (1975). “Explicit calculation of the rarefaction diversity measurement and the determination of sufficient sample size”. Ecology 56, 1459-1461.
    [15] Hurlbert, S. H. (1971). “The nonconcept of species diversity: a critique and alternative parameter”. Ecology 52, 577-586.
    [16] Jost, L. (2010). “The relation between evenness and diversity”. Diversity, 2, 207-232.

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